Ocarina of Time är det första Zelda-spelet som har 3D-grafik, och det släpptes 1998 till Nintendo 64. Som vanligt spelar man som Link, men denna gången har han en ny historia. Vi får följa med Link till Kokiri Forest, där Kokiri-folket bor. Människor som aldrig kan bli vuxna, men Link verkar inte vara en vanlig Kokiri...
Kokiri-skogens beskyddare, det mäktiga Deku-trädet sänder en fé kallad Navi att söka upp Link och hjälpa honom på hans resa. Link träffar prinsessan Zelda och hon berättar att den onde Ganondorf vill ta över kungaslottet, och hela Hyrule. Vad ska han göra åt detta? Jo, samla in de tre diamanterna och öppna the Door of Time för att få tag på Master Sword.
Man spelar som Link i ung ålder i början av spelet, men efter man att fått tag i Master Sword så förflyttas man 7 år framåt i tiden, och spelar som den vuxna Link.

Spelet har en mängd utmaningar och klurigheter som det gäller att tänka till på, och det kommer inte att gå att klara det här spelet på endast en dag!