The Legend of Zelda: Majoras mask är Ocarina of Times efterföljare och är liksom OoT i 3D och till Nintendo 64.
Efter händelserna i Ocarina of Time beger sig Link bort från Hyrule för att söka efter en förlorad vän. I Lost woods blir han överfallen av en konstig figur bärandes en lika konstig mask. Den konstiga figuren slår Link medvetslös och tar hans häst och ocarina. Efter att ha vaknat upp och jagat rätt på den illvilliga varelsen blir han på magiskt sätt förvandlad till en deku scrub. När varelsen flyr lämnar han dock av misstag kvar en av sina två feér, en gul flygande boll, inte helt olik Navi ifrån det föregående spelet, vid namn Tatl.
Med hjälp av henne tar sig Link ut ur den mystiska grotta han hamnat i och träffar på en viss maskförsäljare som förklarar för Link att han hamnat i ett alternativt Hyrule vid namn Termina och att varelsen som attackerade honom kallas Skullkid och att masken han bar hette Majoras mask. Maskförsäljaren berättar också att han kan förvandla Link till en människa igen om han hittar sin ocarina som stals i utbyte mot att han tar tillbaka Majoras mask från Skullkid.
Och så börjar Links äventyr i Termina och kamp mot Skullkid.

Detta spel kräver inte bara skicklighet, utan snabbt tänkande också, och kan precis som sin föregångare knappast klaras på bara en dag.